四個DNA片段在山茶屬分子系統(tǒng)學(xué)研究中的應(yīng)用

選取山茶屬14個組中的10組21種植物對目前常用于屬內(nèi)種間的4個DNA片段(ITS、waxy、tmL-F、rpL16)進(jìn)行序列測定.結(jié)果表明:(1)來自葉綠體基因組的2個片段(trnL-F、rpL16)其PCR擴增和測序都很容易,但兩者的進(jìn)化速率都非常慢,序列矩陣只有很少信息位點(tmL-F含9個,rpL16為20個),不能提供必要的系統(tǒng)發(fā)育信息.(2)來自核基因組的ITS片段其PCR產(chǎn)物比較容易獲得,但其序列的測定存在較多問題.(3)waxy是來自核基因組的另一個片段,其PCR擴增因受模板DNA的數(shù)量和質(zhì)量的影響很大而有一定難度,但其進(jìn)化速率較快,序列矩陣具有較多信息位點(92個),并且在山茶屬是單拷貝,這對于解決山茶屬這類具有許多近緣物種的類群的系統(tǒng)關(guān)系有重要價值.基于tsnL-F、rpL16和waxy三組數(shù)據(jù)所建分子系統(tǒng)樹支持山茶屬為一單系,但屬下系統(tǒng)由于取樣等原因有待進(jìn)一步研究.

作 者： 楊俊波 李洪濤 楊世雄 李德銖 楊瑩燕 YANG Jun-Bo LI Hong-Tao YANG Shi-Xiong LI De-Zhu YANG Yun-Yan   作者單位： 楊俊波,YANG Jun-Bo(中國科學(xué)院昆明植物研究所生物多樣性與生物地理學(xué)重點實驗室,云南,昆明,650204;中國科學(xué)院研究生院,北京,100039)

李洪濤,楊世雄,李德銖,楊瑩燕,LI Hong-Tao,YANG Shi-Xiong,LI De-Zhu,YANG Yun-Yan(中國科學(xué)院昆明植物研究所生物多樣性與生物地理學(xué)重點實驗室,云南,昆明,650204) 

刊 名： 云南植物研究  ISTIC PKU 英文刊名： ACTA BOTANICA YUNNANICA  年，卷(期)： 2006 28(2)  分類號： Q946 Q949  關(guān)鍵詞： 山茶屬   DNA序列   進(jìn)化速率   分子系統(tǒng)學(xué)  

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