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動態(tài)性狀基因座的復合區(qū)間定位

時間:2023-04-27 21:32:21 生物醫(yī)學論文 我要投稿
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動態(tài)性狀基因座的復合區(qū)間定位

動態(tài)性狀因其廣泛性和重要性而備受動植物遺傳育種研究者關注.用分子遺傳學方法探索該類性狀的遺傳機制已成為一個極富挑戰(zhàn)性的研究課題.將關于時間(測定日期)的Legendre多項式鑲嵌在遺傳模型的每個遺傳效應中,以刻畫QTL和協(xié)同因子對動態(tài)性狀變化過程的作用,從而建立動態(tài)性狀基因復合區(qū)間定位分析的數(shù)學模型.利用復合區(qū)間定位策略的優(yōu)勢,提高對控制動態(tài)性狀多個QTL的檢測效力.以F2設計群體為例,闡述了動態(tài)性狀基因復合區(qū)間定位的似然分析原理,推導了參數(shù)似然估計的EM法兩步求解過程.模擬實驗證明,相同設計條件下,復合區(qū)間定位對分布在同一連鎖群上多個影響動態(tài)性狀QTL的檢測效果明顯好于區(qū)間定位;隨著協(xié)同因子數(shù)目的增加,復合區(qū)間定位不但能檢測出更多的甚至所有的QTL,而且對每個QTL分辨得更加清楚.在實際應用過程中,應針對動態(tài)性狀的變化規(guī)律,并考慮計算成本恰當?shù)剡x擇協(xié)同因子數(shù)目.

作 者: 高會江 楊潤清   作者單位: 高會江(東北農(nóng)業(yè)大學動物科學技術學院,哈爾濱,150030)

楊潤清(上海交通大學農(nóng)業(yè)與生物學院,上海,200240) 

刊 名: 科學通報  ISTIC PKU 英文刊名: CHINESE SCIENCE BULLETIN  年,卷(期): 2006 51(13)  分類號: Q3  關鍵詞: 動態(tài)性狀   復合區(qū)間定位   Legendre多項式   極大似然估計   EM算法  

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